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多肽的結構分析方法:質譜、核磁共振、紅外光譜儀儀、紫外光譜、圓二色譜、X射線晶體學

由氨基酸組成的多肽數量驚人,情況非常復雜,由100個氨基酸聚合成線性分子,可形成20100種多肽。僅由Gly、Val、Leu三種氨基酸可以形成六種三肽。因此,確定多肽結構,特別是長鏈多肽結構,是一項非常重要和復雜的工作。純單肽是確保肽結構確認的前提。杭州肽生物可為肽提供1-5種檢測報告。

多肽結構分析方法

(一) 質譜

經典的多肽測序方法包括N末端序列測定的化學方法,如 Ed ** n法、C這些方法存在一些缺陷,如終端酶解和C終端化學降解。例如,N末端氨基酸苯異氰酸酯作為多肽和蛋白質序列測定的標準方法( phenylisothiocyanate,PITC)分析法(即 Ed ** n法,又稱PTH法),測序速度慢(每天50個氨基酸殘基);樣品量大(nmol級或幾十pmol等級);對樣品純度要求很高;對氨基酸殘基的修飾往往有誤識別,而對N末端保護的肽鏈則無法測序。C因為找不到末端化學降解測序法PITC這種理想的化學探針仍然面臨著巨大的困難。質譜( ** ss spectrometry,MS)由于靈敏度高、準確性高、操作方便,備受關注MS當用于多肽序列測量時,隨著分子量的增加,靈敏度和準確性顯著降低,因此使用MS多肽序列分析比蛋白質簡單,許多研究都以多肽為分析對象。近年來,電噴霧電離質譜( electrospray ionisation,ES)基質輔助激光解吸譜( ** trix assisted laser desorption/ Ionization,MALD)等質譜軟電離技術的發展和完善,使極性大分子多肽的分析成為可能,檢測限制fmol級,可測分子量范圍高達100kDa。目前MALD它已成為測量生物大分子特別是蛋白質、多肽分子量和一級結構的有效工具。

(二)核磁共振

核磁共振是由于信號的純數字化、重疊范圍過寬(相對分子質量過大)和信號弱等原因造成的( nuclear ** gnetic resonance,NMR)隨著二維、三維和維度的分析,圖譜在多肽分析中的應用較少NMR分子生物學、計算機處理技術的發展,NMR逐漸成為多肽分析的主要方法之一。NMR它可以用來確定氨基酸序列和定量混合物中的組分含量,但在多分析中仍有許多問題需要解決,如如何使分子量大的肽具有特定的形狀表面,便于定量和定性分析,如何縮短數據處理時間,許多學者正在研究這些問題,NMR對含少于30個氨基酸的多肽進行分析更有效

近期超高場超導磁鐵的建設已經到來NMR分子質量范圍擴大到100kD這么大的蛋白質分子,其NMR譜帶增寬的問題, Wuthrich水平池豫優化光譜法( transversal relaxation optimized spectroscop, TRDSY為此提供了解決方案

(三)紅外光譜儀儀

紅外光譜儀儀是識別有機化合物結構的重要方法,具有樣品量小、不需要高純晶體的特點。通過紅外光譜儀儀研究肽的結構和圖像,可以反映與正常生理條件(水溶液、溫度、酸堿度等)相似的生物大分子的結構變化信息。

采用傅里葉紅外光譜儀儀的方法研究蛋白質和肽的二級結構,主要分析紅外光譜儀儀中的酰胺I譜帶(稱為酰胺I譜帶),酰胺I譜帶為α螺旋,β在1620~425000折疊、不規則卷曲、轉角等不同結構振動峰的加合帶相互重疊px-一個寬譜帶通常在一個不易區分的范圍內。目前,去卷積微分等數學方法常用于區分加合帶中不同波數的每個吸收峰,最后擬合經譜帶獲取每個吸收峰的定量信息。

紅外光譜儀儀可用于監測酰胺質子的交換速率。暴露在表面的質子比中心的質子好H/D交換要快得多。參與二級結構形成的內伸縮區或酰胺質子的交換率為中等。它可以提供多肽或蛋白質中所有氨基酸殘基的信息。

(4)紫外光譜

紫外可見吸收光譜是研究生物大分子溶液構象時非常重要的方法。它對測定樣品沒有特殊要求,只需要處于溶液狀態,因此紫外光譜可以獲得有意義的信息,探索生物大分子結構與功能的關系。紫外線范圍內的蛋白質(250~3000mm)芳香族氨基酸的光吸收主要是由于Trp及Tyr,其次是Phe和His由電子激發引起。

(五)圓二色譜

多肽多為手性分子,實驗室主要采用圓形色譜( circular Dichroi ** spectra,CD)研究溶液中分子的立體結構、反應動力學和構象變化。CD譜具有UV分析相同的精度,但比UV靈敏度高,而且在UV譜中重疊的峰值CD譜中也有可能分開。CD通常是分子橢圓度的測定[θ]由于分子的光學不對稱性,該物質對左右圓偏振光有不同程度的吸收。根據 Cotton效應,[θ該值僅在吸收峰值上具有較大的值,并對應于吸收峰長位置,而多肽紫外吸收光譜主要有兩個吸收峰值,在280m芳香族側鏈引起的吸收峰(主要是Tyr、Tp、Phe),但波長小于230mm不僅有其它氨基酸側鏈的電子躍遷,還有肽鏈骨架本身的電子位移引起的吸收,因此,通過這個區域CD多肽主鏈的構象可以象。

(六)X射線晶體學

X射線晶體學是迄今為止研究蛋白質結構最有效的方法,其精度是任何其他方法都無法比擬的。缺點是蛋白質/多肽晶體難以培養,晶體結構測量周期長。X射線衍射技術可以準確地確定晶體中原子的空間位置;中子衍射和電子衍射技術用于彌補X射線衍射技術的不足。生物大分子單晶中子衍射技術用于確定生物大分子中氫原子的位置;纖維生物大分子X射線衍射技術用于確定螺旋結構等一些周期性結構;電子顯微鏡技術可以確定生物大分子的大小、形狀和亞基排列的二維圖像;它與光學衍射和濾波技術相結合,可以直接顯示生物大分子低分辨率的三維結構。

除上述方法外,場分析質譜、生物鑒定法、放射性同位素標記法和兔疫學法已應用于多肽物質的結構鑒定和分析檢測。

可轉載,不可轉載 ** 商業。文章的部分內容來自多肽藥物的研發。

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